スクウェアのやることは汚いですからね。
どちらかの選択で迷ったら、プレイヤーが不利なほうを選択するのですよ。

つまり、LV制限中に死んだ場合、
　→制限後のLVの分だけ経験値が減る
　→元のLVの分だけ経験値が減る
なので、当然プレイヤーに不利な後者を選ぶわけです。

同様に、全滅した場合
　→再挑戦可能
　→再挑戦不可
でも後者が選択されます。

他にも例がありまして、LVアップまでの経験値が100だった場合に150の経験値を得たら
　→残った50は次のLVの経験値に持ち越し
　→残った50は無かったことにする
これも後者が選ばれています。

スクウェアの開発者がバカなのは言うまでもありませんが、これに文句を言わずに諦めて放置するプレイヤーにも問題があると思います。
より積極的にGMコールなりメールを送るなりしないと、どんどん腐った仕様になってしまいますよ。
現にこっそり敵が強くなったり、スキルが上がりにくくなったりしてますし…